Elkülönített állami pénzalapoknak nevezik azokat az alapokat, amelyeket törvényileg hoznak létre, céljuk az állam egyes feladatainak külső forrásokból történő finanszírozása. A törvénynek tartalmaznia kell az alap rendeltetését, célját, a bevételi forrásait, a lehetséges kiadások körét és egy felelős szakminisztert, aki rendelkezik a pénzek felhasználásáról. A törvény szerint olyan alap nem működhet, amelyik csak tisztán költségvetési forrásból finanszírozza kiadásait, ennek oka, hogy az alapok szerepe az állami költségvetés tehermentesítése a szűkös forrású területeken.
Jelenleg működő alapok:
- Munkaerő-piaci Alap
- Központi Nukleáris Pénzügyi Alap
- Wesselényi Miklós Ár- és Belvízvédelmi Kártalanítási Alap
- Kutatási és Technológiai Innovációs Alap
- Nemzeti Kulturális Alap
- Szülőföld Alap
Az elkülönített állami pénzalapok mérlegeit lásd itt.